جلد 13، شماره 2 - ( بهار و تابستان 1403 )
جلد 13 شماره 2 صفحات 24-14 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Alvanipour H, Javan-Nikkhah M, Aminian H, Alami-Saeid K, Sorkheh K. (2024). Evaluation of the possibility of determining genetic diversity of Mauginiella scaettae isolates using UP-PCR. Plant Pathol. Sci.. 13(2), 14-24. doi:10.61186/pps.13.2.14
URL: http://yujs.yu.ac.ir/pps/article-1-454-fa.html
URL: http://yujs.yu.ac.ir/pps/article-1-454-fa.html
علوانی پور حمید، جوان نیکخواه محمد، امینیان حشمت اله، عالمی سعید خلیل، سرخه کریم. ارزیابی امکان تعیین تنوع ژنتیکی جدایه های Mauginiella scaettae با UP-PCR دانش بیماری شناسی گیاهی 1403; 13 (2) :24-14 10.61186/pps.13.2.14
گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران
چکیده: (503 مشاهده)
قارچ Mauginiella scaettae عامل بیماری مخرب خامج (پوسیدگی گلآذین) شایع در مناطق مختلف کشت نخل خرما است. UP-PCR یکی از روشهای انگشتنگاری DNA است که تکرارپذیری و اختصاصیت بالایی دارد. هدف از این مطالعه بررسی امکان تکثیر DNA با آغازگرهای UP-PCR و امکانسنجی بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های M. scaettae با استفاده از این نشانگر بود. گل آذینهای نخل خرمای دارای علائم بیماری خامج در استانهای خوزستان و فارس نمونه برداری شدند. جدایه های خالص شده، براساس مطالعه خصوصیات ریختی شناسایی و با تکثیر و با توالی یابی ناحیه ی ژنومی ITS-nrDNA تایید شدند. از سه جفت آغازگر UP-15/19، UP-21 و UP-45 به منظور بررسی امکان تکثیر و تعیین تنوع ژنتیکی در بین جدایه های قارچ استفاده شد. پنج جدایهی M. scaettae از سه شهرستان آبادان، شهرستان کارون و بهبهان استان خوزستان و یک نمونه از شهرستان کازرون استان فارس به دست آمدند. جدایه ها از روی چهار رقم نخل خرمای: سایر، خضراوی، خاصی و زاهدی به دست آمدند. واکاوی تبارزایشی با اعتبار سنجی 100 درصد تعلق جدایهی مورد مطالعه را به قارچ M. scaettae تایید نمود. بررسی نتایج تکثیر نشانگر UP-PCR نشان داد بیشترین تعداد باند مشاهده شده مربوط به آغازگر UP15 و کمترین تعداد باند مربوط به آغازگر UP45 است. بین آغازگرهای UP-PCR به کار رفته، تنوع باندی دیده شد، ولی بین پنج جدایه ی M. scaettae در هیچ یک از سه آغازگر UP-PCR تنوع ژنتیکی مشاهده نشد و الگوی باندی جدایه ها برای هر کدام از آغازگرها شبیه هم بود. دلیل عدم تشخیص تنوع ژنتیکی بین جدایه های این بیمارگر با استفاده از این آغازگرها و نشانگر، میتواند ناشی از رابطه ی ژنتیکی نزدیک آنها باشد.
فهرست منابع
1. Abdullah, S.K., Lorca, L.V.L. & Jansson, H.B. (2010). Diseases of date palms (Phoenix dactylifera L.). Basrah Journal for Date Palm Researches, 9 (2), 1-44.
2. Abdullah, S.K., Asensio, L., Monfort, E., Gomez-Vidal, S., Palma-Guerrero, J., Salinas, J., Lopez-Llorca, LV., Jansson, H.B. & Guarro, J. (2005). Occurrence in Elx, SE Spain of inflorescence rot disease of date palms caused by Mauginiella scaettae. Journal of Phytopathology, 153 (7-8), 417-422. [DOI:10.1111/j.1439-0434.2005.00994.x]
3. Ahmed, S.A., Hofmüller, W., Seibold, M., De Hoog, G.S., Harak, H., Tammer, I., Van Diepeningen, A.D. & Behrens-Baumann, W. )2017(. Tintelnotia, a new genus in Phaeosphaeriaceae harbouring agents of cornea and nail infections in humans. Mycoses, 60 (4), 244-253. [DOI:10.1111/myc.12588] [PMID]
4. Al Hassan, K.K. & Waleed, B.K. (1977) Biological study on Mauginiella scaettae Cav. the cause of inflorescence rot of date palm in Iraq. Yearbook of Plant Protection Research, Ministry of Agriculture. Iraq, 1,184-206.
5. Alvanipour, H., Aminian, H., Alami-Saeid, K., Sorkheh, K., Farrokhinejad, R., Ali Nejati, A. & Javan-Nikkhah, M. (2020). Cross-transferability of SSR loci of Phaeosphaeria nodorum to Mauginiella scaettae. Mycologia Iranica, 7(1), 135-142.
6. Alvanipour, H., Aminian, H., Alami-Saeid, K., Sorkheh, K., Farrokhinejad, R. & Javan-Nikkhah, M. (2022). Genetic diversity and pathogenicity of Mauginiella scaettae the causal agent of date palm. Iranian Journal of Plant Protection Science, 53 (1), 57-70. (In Persian).
7. Ariyawansa, H.A., Hyde, K.D., Jayasiri, S.C., Buyck, B., Chethana, K.T., Dai, D.Q., Dai, Y.C., Daranagama, D.A., Jayawardena, R.S., Lücking, R. & Ghobad-Nejhad, M. (2015). Fungal diversity notes 111-252-taxonomic and phylogenetic contributions to fungal taxa. Fungal Diversity, 75, 27-274.
https://doi.org/10.1007/s13225-015-0355-4 [DOI:10.1007/s13225-015-0346-5]
8. Bulat, S.A., Lübeck, M., Mironenko, N., Jensen, D.F. & Lübeck, P.S. (1998). UP-PCR analysis and ITS1 ribotyping of strains of Trichoderma and Gliocladium. Mycological Research, 102 (8), 933-943. [DOI:10.1017/S0953756297005686]
9. Bulat, S.A., Mironenko, N.V. & Zholkevich, Y.G. (1995). Genetic structure of soil population of fungus Fusarium oxysporum Schlechtend.: Fr.: Molecular reidentification of the species and genetic differentiation of isolates using polymerase chain reaction. Russian Journal of Genetics, 31 (3), 271-278.
10. Bulat, S.A., Mironenko, N.V., Lapteva, M.N. & Strelchenko, P.P. (1994). Polymerase chain reaction with universal primers (UP-PCR) and its application to plant genome analysis. Conservation of Plant Genes II: Utilization of ancient and modern DNA, 48, 113-129.
11. Cowger, C., & Silva-Rojas, H. V. (2006). Frequency of Phaeosphaeria nodorum, the sexual stage of Stagonospora nodorum, on winter wheat in North Carolina. Phytopathology, 96 (8), 860-866. [DOI:10.1094/PHYTO-96-0860] [PMID]
12. Crous, P.W., Shivas, R.G., Quaedvlieg, W.V., Van der Bank, M., Zhang, Y., Summerell, B.A., Guarro, J., Wingfield, M.J., Wood, A.R., Alfenas, A.C. & Braun, U. (2014). Fungal Planet description sheets: 214-280. Persoonia-Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi, 32(1), 184-306. [DOI:10.3767/003158514X682395] [PMID] []
13. De Gruyter, J., Woudenberg, J. H. C., Aveskamp, M. M., Verkley, G. J. M., Groenewald, J. Z., & Crous, P. W. (2013). Redisposition of Phoma-like anamorphs in Pleosporales. Studies in Mycology, 75(1), 1-36. [DOI:10.3114/sim0004] [PMID] []
14. Demissie, Z.A., Brown, W.G. & Loewen, M.C. (2019). A universally primed-polymerase chain reaction (UP-PCR) marker to discriminate Clonostachys rosea ACM941 from Related Strains. Journal of Fungi, 5 (2), 1-11. [DOI:10.3390/jof5020039] [PMID] []
15. Galehdari, H., Foroughmand, A.M., Roshanfekr, H. & Nzari, M. (2006). Exhaustive Genetic Engineering. Golhai Behesht Publications. 419 pp. (in Persian).
16. Rattan, S.S. & Aldboon, A.H. (1980). Notes on fungi associated with date-palm I. Sydowia, 32, 246-273.
17. Sheikholeslami, M., Okhovat, S.M., Hejaroude, G.h., Sharifi Tehrani, A., Javan Nikkhah, M. & Najafi Mirak, T. (2006). Investigation on interaction of isolate-genotype between Erysiphe betae and Beta vulgaris under greenhouse condition, Journal of Sugar Beet, 21 (2), 123-135. (in Persian).
18. Vu, D., Groenewald, M., De Vries, M., Gehrmann, T., Stielow, B., Eberhardt, U., Al-Hatmi, A., Groenewald, J.Z., Cardinali, G., Houbraken, J., Boekhout, T., Crous, P.W., Robert, W. & Verkley, G.J.M. (2019). Large-scale generation and analysis of filamentous fungal DNA barcodes boosts coverage for kingdom fungi and reveals thresholds for fungal species and higher taxon delimitation. Studies in Mycology, 92 (1), 135-154. [DOI:10.1016/j.simyco.2018.05.001] [PMID] []
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
