logo
جلد 14، شماره 1 - ( پاییز و زمستان 1403 )                   جلد 14 شماره 1 صفحات 8-1 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Gerami Nooghabi M. (2025). Serological and molecular detection of barley yellow mosaic virus in Khorasan Razavi Province, Iran. Plant Pathol. Sci.. 14(1), 1-8.
URL: http://yujs.yu.ac.ir/pps/article-1-463-fa.html
گرامی نوقابی محدثه.(1403). ردیابی سرولوژیکی و مولکولی ویروس موزاییک زرد جو در استان خراسان رضوی، ایران دانش بیماری شناسی گیاهی 14 (1) :8-1

URL: http://yujs.yu.ac.ir/pps/article-1-463-fa.html


دانشکده علوم، مجتمع آموزش عالی گناباد، گناباد، ایران
چکیده:   (1541 مشاهده)
موزاییک زرد ناشی از ویروس موزاییک زرد جو (BaYMV)، که توسط شبه قارچ Polymyxa graminis منتقل می­شود، یکی از بیماریهای مهم ویروسی جو در جهان است.  برای ردیابی سرولوژیکی و مولکولی این ویروس از مزرعه ­های جو استان خراسان رضوی، شمال شرق ایران، 86 نمونه برگ به صورت تصادفی و یا دارای علایمی شامل موزاییک، زردی و رگبرگ روشنی در اوخر زمستان سال 1400، جمع ­آوری شدند. نمونه ها پس از انتقال به آزمایشگاه توسط آزمون های سرولوژیکی الایزا و مولکولی واکنش زنجیره‌ای پلیمراز- ترانسکریپتاز معکوس (RT-PCR) مورد بررسی قرار گرفتند. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی BaYMV طراحی شده، قطعه ای به طول 800  جفت باز مربوط به پروتیین پوششی ویروس تکثیر شد. از بین جدایه های مثبت آزمون RT-PCR، قطعه دی ان ا تکثیر شده مربوط به جدایه بجستان پس از استخراج از ژل، تعیین توالی گردید. توالی دریافتی جدایه بجستان , BaYMV پس از تایید صحت  با استفاذه از برنامه بلاست، به همراه سایر توالی های پروتیین پوششی  BaYMV موجود در بانک ژن NCBI به وسیله نرم افزارهای DNAMAN-7 و Vector NTI مورد واکاوی فیلوژنتیکی قرار گرفت. قطعه تعیین توالی شده جدایه بجستان دارای بیشترین شباهت در سطح نوکلئوتیدی (79/94 درصد) و آمینواسیدی (59/90 درصد) با قطعه مشابه یک جدایه از اروپا بود. این اولین گزارش وقوع BaYMV از شهرستان بجستان استان خراسان رضوی ایران است.
واژه‌های کلیدی: پروتیین پوششی، BaYMV، ELISA، RT-PCR
متن کامل [PDF 1107 kb]   (719 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ویروس
دریافت: 1403/8/15 | پذیرش: 1403/10/10 | انتشار: 1403/12/1

فهرست منابع
1. Adams, M.J., Antoniw, J. F. & Fauquet, C. M. (2005). Molecular criteria for genus and species discrimination within the family Potyviridae. Archive of Virology, 150, 459-479. DOI: 10.1007/s00705-004-0440-6 [DOI:10.1007/s00705-004-0440-6] [PMID]
2. Budge, G. E., Ratti, C., Rubies, A. C., Lockley, D., Bonnefoy, M., Vallega, V. & Henry, C. (2008). Assessment of the agronomic impact of soil-borne cereal mosaic virus to UK winter wheat cultivars varieties across Europe. European Journal of Plant Pathology, 120, 259-272. [DOI:10.1007/s10658-007-9214-9]
3. Chang, S., Puryear, J. & Cairney, J. (1993). A simple and efficient method for isolation RNA from pine trees. Journal of Plant Molecular Biology, 11, 113-116. DOI:10.1007/BF02670468. [DOI:10.1007/BF02670468]
4. Chen, J., Du, J. & Adams, M. J. (2000). Sequence diversity in the coat protein coding region of wheat yellow mosaic bymovirus isolates from China. Journal of Phytopathology. 148, 515-521. https://doi.org/10.1046/j.1439-0434.2000.00555.x [DOI:10.1046/j.1439-0434.2000.00555.x.]
5. Chen, J., Shi, N., Cheng, Y., Diao, A., Chen, J., Wilson, T. M., Antoniw, J. F. & Adams, M. J. (1999). Molecular analysis of Barley yellow mosaic virus isolates from China. Virus Research, 64, 13-21. DOI: 10.1016/s0168-1702(99)00076-3 [DOI:10.1016/S0168-1702(99)00076-3] [PMID]
6. Cheng, C., Kan, J., Li, S., Jiang, C., He, X., Shen, H., Xu, R., Li, B., Feng, Z. & Yang, P. (2022). Mutation of barley HvPDIL5-1 improves resistance to yellow mosaic virus disease without growth or yield penalties. Frontiers in Plant Science, 13, 1018379. [DOI:10.3389/fpls.2022.1018379] [PMID] []
7. doi:10.3389/fpls.2022.1018379. [DOI:10.3389/fpls.2022.1018379] [PMID] []
8. Clark, M. F. & Adams, A. N. (1977). Characterization of the microplate method of Enzyme-linked Immunosurbent Assay for the detection of plant viruses. Journal of General Virology, 34, 475-483. DOI: 10.1099/0022-1317-34-3-475. [DOI:10.1099/0022-1317-34-3-475] [PMID]
9. Davidson, A. D., Prols, M., Schell, J. & Steinbiss, H. H. (1999). The nucleotide sequence of RNA 2 of Barley yellow mosaic virus. Journal of General Virology, 72, 989-993. DOI: 10.1099/0022-1317-72-4-989. [DOI:10.1099/0022-1317-72-4-989] [PMID]
10. Hosseini, A., Jafarpour, B., Mahdikhany Moghadam, M., Mehrvar, Zaki Aghl, M., Rubies, C. A. & Ratti, C. (2014). Occurrence of soil-borne cereal viruses and molecular characterization of the coat protein gene of barley yellow mosaic virus isolates from Iran. Journal of Plant Pathology, 96 (2), 391-396. DOI: 10.22067/JPP.V28I4.45300.
11. Huth, W. & Lesemann, D. E. (1996). Fungus-transmitted soil-borne viruses on rye in Germany. Nachrichtenblatt des Deutschen Pflanzenschutzdienstes, 103, 120-124.
12. DOI: 10.1007/s007050050663. [DOI:10.1007/s007050050663] [PMID]
13. Jiang, C., Kan, J., Ordon, F. Perovic, D and Yang, P.(2020). Bymovirus-induced yellow mosaic diseases in barley and wheat viruses, genetic resistances and functional aspects. Theoritical Applied Genetics, 133, 1623-1640. https://doi.org/10.1007/s00122-020-03555-7 [DOI:10.1007/s00122-020-03555-7.] [PMID]
14. Kanyuka, K., Mcgrann, G., Alhudabi, K., Hariri, D. & Adams, J. (2004). Biological and sequence analysis of a novel European isolate of Barley mild mosaic virus that overcome the barley rym5 resistance gene. Archive of Virology, 149, 1469-1480. [DOI:10.1007/s00705-004-0318-7] [PMID]
15. DOI: 10.1007/s00705-004-0318-7. [DOI:10.1007/s00705-004-0318-7] [PMID]
16. Kashiwazaki, S., Nomura, K., Kuroda, H., Ito, K. & Hibino, H. (1992). Sequence analysis of the T-terminal halves of RNA 1 of two strains of barley mild mosaic virus. Journal of General Virology, 73, 2173-2181. DOI: 10.1099/0022-1317-73-9-2173. [DOI:10.1099/0022-1317-73-9-2173] [PMID]
17. Kuhne, T. (2009). Soil-borne viruses affecting cereals-known for long but still a threat. Virus Research, 141, 147-183. DOI: 10.1016/j.virusres.2008.05.019. [DOI:10.1016/j.virusres.2008.05.019] [PMID]
18. Kutluk Yilmaz, N. D., Lyons, R. L., Smith, M. J. & Kanyuka, K. (2011). Investigation of soilborne mosaic virus diseases transmitted by Polymyxa graminis in cereal production areas of the Anatolian part of Turkey. Journal of Plant Pathology, 130, 59-72. https://doi.org/10.1007/s10658-010-9731-9 [DOI:10.1007/s10658-010-9731-9.]
19. Nishigawa, H., hajiwara, T., Yomoto, M., Sotome, T., kato, T. & Natsuaki, T. (2008). Molecular phylogenetic analysis of Barley yellow mosaic virus. Archive of Virolology, 153, 1783-1786. DOI: 10.1007/s00705-008-0163-1. [DOI:10.1007/s00705-008-0163-1] [PMID]
20. Nomura, K., Kashiwazaki, S., Hibino, H., Inoue, T., Nakata, E., Tsuzaki, Y. & Okuyama S. (1996). Biological and serological properties of two strains of barley mild mosaic virus. Journal of Phytopathology, 144, 103-107. https://doi.org/10.1111/j.1439-0434.1996.tb01496.x [DOI:10.1111/j.1439-0434.1996.tb01496.x.]
21. Okada Y., Kato T., Yoshida M., Saito A. (2008). Identification of Japanese strains of barley yellow mosaic virus by RT-PCR/ RFLP analysis of the coat protein-coding region. Journal of General Plant Pathology, 74, 258-263. [DOI:10.1007/s10327-008-0095-3]
22. Okada, Y., Kanatani, R., Arai, S. & Ito, K. (2004). Interaction between barley yellow mosaic disease-resistance genes rym1 and rym5, in the response to BaYMV strains. Breeding Science, 54, 319-325. DOI:10.1270/jsbbs.54.319. [DOI:10.1270/jsbbs.54.319]
23. Pan, Y., Zhu, J., Hong, Y., Zhang, M., Lv, C., Guo, B., Shen, H., Xu, X., & Xu, R. (2022). Screening of stable resistant accessions and identification of resistance loci to barley yellow mosaic virus disease. Peer-Reviewed Journal, 10, e13128, https://doi.org/10.7717/peerj.13128 [DOI:10.7717/peerj.13128.] [PMID] []
24. Peerenboom, E., Prols, M., Schell, J., Steinbiss, H. H. & Davidson, A. D. (1992). The complete nucleotide sequence of RNA1 of a German isolate of Barley yellow mosaic virus and its comparison with a Japanese isolate. Journal of General Virology. 73, 1303-1308. DOI: 10.1099/0022-1317-73-5-1303. [DOI:10.1099/0022-1317-73-5-1303] [PMID]
25. Rochon, D. A., Kakani, K., Robbis, M. & Reade, R. (2004). Molecular aspects of plant virus transmission by Olpidium and Plasmodioohorid vectors. Annual Review of Phthopathology, 42, 211-241. DOI: 10.1146/annurev.phyto.42.040803.140317. [DOI:10.1146/annurev.phyto.42.040803.140317] [PMID]
26. Sahandpour, A. & Izadpanah, K. (1999). Report of Polymyxa graminis and a virus resembling wheat soil-borne mosaic virus from Fars. Iranian Journal of Plant Pathology 35, 61. DOI: 10.1046/j.1364-3703.2003.00177.x. [DOI:10.1046/j.1364-3703.2003.00177.x] [PMID]
27. Vaianopoulos, C., Legreve, A., Barbier, A., Steyer, S., Maraite, H. & bragard, C. (2003). Detection of Barley yellow mosaic virus and Barley mild mosaic virus by RT-PCR on resistant barley cultivars. Parasitica, 59, 67-74.

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.