<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Plant Pathology Science</title>
<title_fa>دانش بیماری شناسی گیاهی</title_fa>
<short_title>Plant Pathol. Sci.</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://yujs.yu.ac.ir/pps</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2251-9270</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2588-6290</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61186/pps</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1398</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2019</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>8</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تکنیکِ نسل جدید توالی‌یابی و کاربرد آن در ویروس‌شناسی گیاهی</title_fa>
	<title>Next Generation Sequencing Technique and Its Application in Plant Virology</title>
	<subject_fa>تخصصي</subject_fa>
	<subject>Special</subject>
	<content_type_fa>ترویجی</content_type_fa>
	<content_type>Extentional</content_type>
	<abstract_fa>&lt;h2 dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;margin: 0px 0px 2.66px; text-align: justify; line-height: 150%; unicode-bidi: embed; direction: rtl;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;داودی ز، حیدرنژاد ج و معصومی ح (1398) تکنیکِ نسل جدید توالی&#8204;یابی و کاربرد آن در ویروس&#8204;شناسی گیاهی. &lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;دانش بیماری&#8204;شناسی گیاهی 8(2):85-77. &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;DOI: 10.2982/PPS.8.2.77 &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;تعیین توالی دی&#8204;اِن&#8204;اِ در&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;همه شاخه&#8204;های&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;علوم&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;زیستی&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;کاربرد دارد&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; در میان اولین فن&#8204;آوری&#8204;های پیشرفته نسل توالی&#8204;یابی، دانشمندان&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;با&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;ظهور&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;توالی&#8204;یابی&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;سنگر،&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;توانستند&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;اطلاعات&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;ژنتیکی&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;گونه&#8204;ها را در هر سیستم&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;بیولوژیکی مشخص&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;کنند. اگرچه هنوز هم این تکنیک به&#8204;دلیل کیفیت توالی&#8204;های خوانده شده، مورد توجه است، اما&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;محدودیت هایی&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;چون&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;مقیاس کار،&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;سرعت&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;و&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;تفکیک&#8204;پذیری&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;موانعی&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;است&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;که&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;مانع&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;دسترسی دانشمندان&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;به&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;اطلاعات اساسی&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;مورد&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;نیاز&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;شده&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;است&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; برای&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;غلبه&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;بر این&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;موانع،&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;فنآوری توالی&#8204;یابی نسل جدید (&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;NGS&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;)&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;در شروع قرن 21 ارائه شد. این فن&#8204;آوری، توالی&#8204;یابی بسیار کارآمد، سریع و کم هزینه را نسبت به فن&#8204;آوری استاندارد و سنتی توسعه یافته در اواخر دهه 1970، فراهم نمود. در سال 2009 فن&#8204;آوری &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;NGS&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; برای چندین جنبه ویروس&#8204;شناسی گیاهی از جمله توالی&#8204;یابی ژنوم، کشف و ردیابی، اکولوژی، اپیدمولوژی و تکثیر ویروس&#8204;ها و ویروئیدها استفاده شد. انتظار می&#8204;رود که فن&#8204;آوری &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;NGS&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; نقش بسیار مهمی در بسیاری از تحقیقات ویروس&#8204;شناسی گیاهی داشته باشد.&lt;/span&gt;&lt;/h2&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;margin: 0px 0px 2.66px; text-align: justify; line-height: 150%;&quot;&gt;Davoodi Z, Heidarnejad J and Masoumi H (2019) Next generation sequencing technique and its application in plant virology. Plant Pathology Science 8(2):77-85. DOI:10.2982/PPS.8.2.77&lt;br&gt;
&lt;br&gt;
DNA sequencing is used by virtually all branches of biological research. Among the first advanced sequencing technologies, scientists were able to elucidate genetic information from any particular biological system using the Sanger sequencing method. Although Sanger sequencing generates high quality sequencing data, its limitations such as scalability, speed and resolution often preclude scientists from obtaining the essential information. To overcome these barriers, next generation sequencing technique (NGS) was introduced at the beginning of the 21&lt;sup&gt;st&lt;/sup&gt; century. This technique provided a highly efficient, rapid, and low cost DNA sequencing platform beyond the reach of the standard and traditional DNA sequencing technologies that developed in late 1970s. In 2009, NGS technologies began to be applied to several areas of plant virology including virus/viroid genome sequencing, discovery and detection, ecology, epidemiology and replication. It is expected that NGS plays very significant roles in many plant virology researches.&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;/p&gt;</abstract>
	<keyword_fa>توالی‌یابی دی‌اِن‌اِ, ویروئید, ویروس, Illumina/Solexa</keyword_fa>
	<keyword>DNA sequencing, Viroid, Virus, Illumina/Solexa</keyword>
	<start_page>77</start_page>
	<end_page>85</end_page>
	<web_url>http://yujs.yu.ac.ir/pps/browse.php?a_code=A-10-265-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>zohreh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Davoodi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>زهره</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>داودی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>z.davoodi20@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846002808</code>
	<orcid>10031947532846002808</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Plant Pathology, College of Agriculture, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>jahangir</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>heydarnejad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>جهانگیر</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حیدرنژاد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>jhehdarnejad@uk.ac.ir</email>
	<code>10031947532846002809</code>
	<orcid>10031947532846002809</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Plant Pathology, College of Agriculture, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Hossein</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Masoomi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حسین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>معصومی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>masooi@uk.ac.ir</email>
	<code>10031947532846002810</code>
	<orcid>10031947532846002810</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Plant Pathology, College of Agriculture, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
