جلد 11، شماره 1 - ( (پاییز و زمستان) 1400 )                   جلد 11 شماره 1 صفحات 12-1 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم‌آّباد ، samira.pakbaz@gmail.com
چکیده:   (350 مشاهده)
 پاکباز س، درویش‌نیا م، نقوی ا (1400) جایگاه نسب­ شناسی جدایه استان لرستان ایران ویروس برگ بادبزنی انگور. دانش بیماری‌شناسی گیاهی 11(1):12-1.       
     10.2982/PPS.11.1.1 Doi:   
مقدمه: ویروس برگ بادبزنی(GFLV) یک ویروس‌ مهم آلوده کننده انگور در جهان است. مواد و روش‌ها: انگورهای دارای نشانه GFLV از حومه شهر خرم‌آباد در استان لرستان ایران،  در بهار 1399 نمونه‌برداری شدند و آزمون RT-PCR جهت تکثیر ژن GFLV-CP آنها انجام و محصول واکنش توالی‌یابی شد. یافته‌ها: آغازگرهای اختصاصی توانستند قطعه‌ای به طول bp 1515 مربوط به ژن CP را تکثیر کنند. بر اساس توالی نوکلئوتیدی این قطعه، GFLV برای نخستین بار در این منطقه شناسایی شد. تشابه ترادف نوکلئوتیدی این جدایه به میزان 64/95 -14/89 درصد با دیگر جدایه‌های موجود در بانک ژن NCBI تشخیص داده شد. همچنین در درخت نسب­ شناسی  این جدایه ­ها بر اساس ناحیه ژنومی CP، جدایه‌های GFLV در دو گروه I و II خوشه‌بندی شدند. جدایه لرستان GFLV همراه با جدایه‌های GFLV متعلق به ناحیه شمال غربی کشور و جدایه شهر تاکستان در یک زیرشاخه در گروه I قرار گرفتند و جدایه‌های مربوط به سایر کشورها نیز در این گروه در یک زیرشاخه مجزا قرار گرفتند. همچنین جدایه‌های شرق کشور و استان‌های فارس و کهگیلویه و بویراحمد نیز در گروه II و در زیرشاخه‌های متفاوت قرار گرفتند. نتیجه‌گیری: یافته­ های این پژوهش‌ بیانگر بومی بودن ویروس، خاستگاه احتمالی آن از ایران و سپس گسترش آن به سایر نقاط دنیا و نیز اثر جدایی جغرافیایی در تکامل GFLV می‌باشد.

 
واژه‌های کلیدی:  توالی‌یابی، GFLV، RT-PCR
متن کامل [PDF 554 kb]   (124 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: تخصصي

فهرست منابع
1. Andert-Link P, Laporte C, Valat L, Ritzenthaler C, Demangeat G, Ving E, Laval V, Pfeiffer P, Stussi-Garaud C, Fuchs M (2004) Grapevine fanleaf virus: still a major threat to the grapevine industry. Journal of Plant Pathology 86:183-195.
2. Fuchs M (2020) Grapevine viruses: a multitude of diverse species with simple but overall poorly adopted management solutions in the vineyard. Journal of Plant Pathology 102:643-653. [DOI:10.1007/s42161-020-00579-2]
3. Gharouni S, Karimishahri M, Azaddisfani F (2022) Distribution and Phylogeny of Grapevine fanleaf virus in Vineyards of Khorasan Razavi Province Based on Coat Protein Region, Journal of Plant Protection 35:421-431. (In Persian with English Abstract).
4. Gholampour Z, Kargar M, Zakiaghl M, Siampour M, Mehrvar M, Izadpanah K (2017) Dynamics of the population structure and genetic variability within Iranian isolates of Grapevine fanleaf virus: evidence for polyphyletic origin. Acta Virologica, 61:324-335. [DOI:10.4149/av_2017_311] [PMID]
5. Gholampour Z, Zaki-Aghl M (2016) Comparison of RNA Extraction Methods for the Identification of Grapevine fanleaf virus. Journal of Plant Protection 30:127-133. (In Persian with English Abstract).
6. Izadpanah K, Zaki-Aghl M, Zhang Y, Daubert S, Rowhani A (2003) Bermuda grass as a potential reservoir host for Grapevine fanleaf virus. Plant Disease 87:1179-1182. [DOI:10.1094/PDIS.2003.87.10.1179] [PMID]
7. Kargar M, Zakiaghl M, Masoumi M, Mehrvar M, Izadpanah K (2017) Analysis of genetic diversity of Grapevine fanleaf virus isolate from Fars and Kohgiluyeh-Boyer Ahmad provinces. Iranian Journal of Plant Pathology 52:375-391. (In Persian with English Abstract).
8. Martelli GP, Savino V (1990) Fanleaf Degeneration. PP.48-49. In: RC Pearson, A Goheen (eds.). Compendium of Grape Diseases. APS Press, St. Paul, MN, USA.
9. Moradi R, Koolivand D, Eini O, Hajizadeh M (2018) Molecular Identification of four important Nepovirus from vineyards of Zanjan province, Iranian Journal of Plant Protection Science 49:99-110. (In Persian with English Abstract).
10. Nourinezhad Zarghani SH, Shams-Bakhsh M, Sokhandan-Bashir N, Pazhouhandeh M (2012) Identification and detection of Iranian isolates of Grapevine fanleaf virus using green-grafting and RT-PCR. Iranian Journal of Plant Pathology 48:381-391. (In Persian with English Abstract).
11. Panno S, Caruso AG, Bertacca S, Pisciotta A, Lorenzo RD, Marchione S, Matić S, Davino S (2021) Genetic structure and molecular variability of Grapevine fanleaf virus in Sicily. Agriculture 11:496. [DOI:10.3390/agriculture11060496]
12. Parvizi R (1989) Incidence of Grapevine fanleaf virus in Uromia. Procced 9th Plant Protection Congress. Iran, Mashhad. P.164.
13. Pourrahim R, Farzadfar S, Golnaraghi AR, Ahoonmanesh A (2007) Partial molecular characterization of some Grapevine fanleaf virus isolates from North-east of Iran. Journal of Phytopathology 155:754-757. [DOI:10.1111/j.1439-0434.2007.01299.x]
14. Rakhshandehroo F, Pourrahim R, Zamanizadeh H, Rezaee S, Mohammadi M (2005) Incidence and distribution of viruses Infecting Iranian vineyards. Journal of Phytopathology 153:480-484. [DOI:10.1111/j.1439-0434.2005.01006.x]
15. Reisch BI, Owens CL, Cousins PS (2012) Grape. In Fruit Breeding. Springer, Boston, MA. 225-262. [DOI:10.1007/978-1-4419-0763-9_7]
16. Sanfacon H, Wellink J, Le Gall O, Karasev A, Vlugt vander R, Wetzel T (2009) Secoviridae: a proposed family of plant viruses within the order Picornavirales that combines the families Sequiviridae and Comoviridae, the unassigned genera Cheravirus and Sadwavirus, and the proposed genus Torradovirus. Archives of Virology 154:899-907. [DOI:10.1007/s00705-009-0367-z] [PMID]
17. Sokhandan-Bashir N, Melcher U (2012) Population genetic analysis of Grapevine fanleaf virus. Archives of Virology 157:1919-1929. [DOI:10.1007/s00705-012-1381-0] [PMID]
18. Vuittenez A (1970) Fanleaf of Grapevine. Pp.217-228. In: NW Frazier (ed.). Virus Disease of Small Fruits and Grapevine. University of California, Berkley. -----------

بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.