Plant Pathology Science

fa ارزیابی امکان تعیین تنوع ژنتیکی جدایه های Mauginiella scaettae با UP-PCR Evaluation of the possibility of determining genetic diversity of Mauginiella scaettae isolates using UP-PCR قارچ Mycology پژوهشي Research <div style="text-align: justify;">قارچ Mauginiella scaettae عامل بیماری مخرب خامج (پوسیدگی گلآذین) شایع در مناطق مختلف کشت نخل خرما است. UP-PCR یکی از روشهای انگشتنگاری DNA است که تکرارپذیری و اختصاصیت بالایی دارد. هدف از این مطالعه بررسی امکان تکثیر DNA با آغازگرهای UP-PCR و امکانسنجی بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های M. scaettae با استفاده از این نشانگر بود. گل آذینهای نخل خرمای دارای علائم بیماری خامج در استانهای خوزستان و فارس نمونه برداری شدند. جدایه های خالص شده، براساس مطالعه خصوصیات ریختی شناسایی و با تکثیر و با توالی یابی ناحیه ی ژنومی ITS-nrDNA تایید شدند. از سه جفت آغازگر  UP-15/19، UP-21 و UP-45 به منظور بررسی امکان تکثیر و تعیین تنوع ژنتیکی در بین جدایه های قارچ استفاده شد. پنج جدایهی M. scaettae از سه شهرستان آبادان، شهرستان کارون و بهبهان استان خوزستان و یک نمونه از شهرستان کازرون استان فارس به دست آمدند. جدایه ها از روی چهار رقم نخل خرمای: سایر، خضراوی، خاصی و زاهدی به دست آمدند. واکاوی تبارزایشی با اعتبار سنجی 100 درصد تعلق جدایهی مورد مطالعه را به قارچ M. scaettae تایید نمود. بررسی نتایج تکثیر نشانگر UP-PCR نشان داد بیشترین تعداد باند مشاهده شده مربوط به آغازگر UP15 و کمترین تعداد باند مربوط به آغازگر UP45 است. بین آغازگرهای  UP-PCR به کار رفته، تنوع باندی دیده شد، ولی بین پنج جدایه ی M. scaettae در هیچ یک از سه آغازگر UP-PCR تنوع ژنتیکی مشاهده نشد و الگوی باندی جدایه ها برای هر کدام از آغازگرها شبیه هم بود. دلیل عدم تشخیص تنوع ژنتیکی بین جدایه های این بیمارگر با استفاده از این آغازگرها و نشانگر، میتواند ناشی از رابطه ی ژنتیکی نزدیک آنها باشد.  </div> <div style="text-align: justify;"> The fungus Mauginiella scaettae is the causative agent of the destructive Khamej disease (inflorescence rot) common in various date palm cultivation areas. UP-PCR is one of the DNA fingerprinting methods with high reproducibility and specificity. The aim of this study was to investigate the possibility of DNA amplification with UP-PCR primers and the feasibility of studying the genetic diversity of M. scaettae isolates using this marker. Date palm inflorescences with Khamej disease symptoms were sampled in Khuzestan and Fars provinces. The purified isolates were identified based on morphological characteristics and confirmed by amplification and sequencing of the ITS-nrDNA genomic region. Three primer pairs UP-15/19, UP-21 and UP-45 were used to investigate the possibility of amplification and determine the genetic diversity among the fungal isolates. Five isolates of M. scaettae were obtained from three cities: Abadan, Karun and Behbahan in Khuzestan province and one sample from Kazerun in Fars province. The isolates were obtained from four date palm cultivars: Sayer, Khazravi, Khasi and Zahedi. Constructing of phylogenetic tree based on ITS sequences confirmed that the isolate belonged to M. scaettae fungus with 100% bootstrap values. Examination of the UP-PCR marker amplification results showed that the highest number of observed bands was related to the UP15 primer and the lowest number of bands was related to the UP45 primer. Band diversity was observed between the UP-PCR primers used, but genetic diversity was not observed among the five M. scaettae isolates in any of the three UP-PCR primers and the banding pattern of the isolates was similar for each primer. The reason for the failure to detect genetic diversity between isolates of this pathogen using these primers and the marker could be due to their close genetic relationship.  </div> انگشت نگاری, بیماری, خامج, نخل خرما Fingerprinting, Disease, Khamej, Date palm 14 24 http://yujs.yu.ac.ir/pps/browse.php?a_code=A-10-457-1&slc_lang=fa&sid=1 Hamid Alvanipour حمید علوانی پور 10031947532846005631 10031947532846005631 Yes Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iran گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران Mohammad Javan-Nikkhah محمد جوان نیکخواه jnikkhah@ut.ac.ir 10031947532846005632 10031947532846005632 No Department of Plant Protection, Faculty of Agricultural Science & Engineering, University of Tehran, Karaj, Iran گروه گیاه پزشکی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، دانشگاه تهران، کرج، ایران Heshmatollah Aminian حشمت اله امینیان haminian@ut.ac.ir 10031947532846005633 10031947532846005633 No Department of Agricultural Entomology and Plant Pathology, College of Agricultural Technology (Aburaihan), Pakdasht, Iran گروه حشره‌شناسی و بیماریهای گیاهی، دانشکده فناوری کشاورزی، دانشگاه تهران، پاکدشت Khalil Alami-Saeid خلیل عالمی سعید khalilalamisaeid@gmail.com 10031947532846005634 10031947532846005634 No Department of Production Engineering and Plant Genetics, Faculty of Agriculture, Agricultural Sciences and Natural Resources University of Khuzestan, Mollasani ,Iran گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، ملاثانی، ایران Karim Sorkheh کریم سرخه k.sorkheh@scu.ac.ir 10031947532846005635 10031947532846005635 No Department of Production Engineering and Plant Genetics, Faculty of Agriculture, Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iran گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز ، اهواز، ایران