Plant Pathology Science
دانش بیماری شناسی گیاهی
Plant Pathol. Sci.
Agriculture
http://yujs.yu.ac.ir/pps
1
admin
2251-9270
2588-6290
8
10.52547/pps
14
8888
13
fa
jalali
1398
6
1
gregorian
2019
9
1
8
2
online
1
fulltext
fa
تکنیکِ نسل جدید توالییابی و کاربرد آن در ویروسشناسی گیاهی
Next Generation Sequencing Technique and Its Application in Plant Virology
تخصصي
Special
ترویجی
Extentional
<h2 dir="RTL" style="margin: 0px 0px 2.66px; text-align: justify; line-height: 150%; unicode-bidi: embed; direction: rtl;"><span style="font-size:12.0pt;">داودی ز، حیدرنژاد ج و معصومی ح (1398) تکنیکِ نسل جدید توالییابی و کاربرد آن در ویروسشناسی گیاهی. </span><span style="font-size:12.0pt;">دانش بیماریشناسی گیاهی 8(2):85-77. </span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">DOI: 10.2982/PPS.8.2.77 </span></span></span><span style="font-size:12.0pt;"></span><br>
<br>
<span style="font-size:12.0pt;">تعیین توالی دیاِناِ در</span> <span style="font-size:12.0pt;">همه شاخههای</span> <span style="font-size:12.0pt;">علوم</span> <span style="font-size:12.0pt;">زیستی</span> <span style="font-size:12.0pt;">کاربرد دارد</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">.</span></span></span><span style="font-size:12.0pt;"> در میان اولین فنآوریهای پیشرفته نسل توالییابی، دانشمندان</span> <span style="font-size:12.0pt;">با</span> <span style="font-size:12.0pt;">ظهور</span> <span style="font-size:12.0pt;">توالییابی</span> <span style="font-size:12.0pt;">سنگر،</span> <span style="font-size:12.0pt;">توانستند</span> <span style="font-size:12.0pt;">اطلاعات</span> <span style="font-size:12.0pt;">ژنتیکی</span> <span style="font-size:12.0pt;">گونهها را در هر سیستم</span> <span style="font-size:12.0pt;">بیولوژیکی مشخص</span> <span style="font-size:12.0pt;">کنند. اگرچه هنوز هم این تکنیک بهدلیل کیفیت توالیهای خوانده شده، مورد توجه است، اما</span> <span style="font-size:12.0pt;">محدودیت هایی</span> <span style="font-size:12.0pt;">چون</span> <span style="font-size:12.0pt;">مقیاس کار،</span> <span style="font-size:12.0pt;">سرعت</span> <span style="font-size:12.0pt;">و</span> <span style="font-size:12.0pt;">تفکیکپذیری</span> <span style="font-size:12.0pt;">موانعی</span> <span style="font-size:12.0pt;">است</span> <span style="font-size:12.0pt;">که</span> <span style="font-size:12.0pt;">مانع</span> <span style="font-size:12.0pt;">دسترسی دانشمندان</span> <span style="font-size:12.0pt;">به</span> <span style="font-size:12.0pt;">اطلاعات اساسی</span> <span style="font-size:12.0pt;">مورد</span> <span style="font-size:12.0pt;">نیاز</span> <span style="font-size:12.0pt;">شده</span> <span style="font-size:12.0pt;">است</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">.</span></span></span><span style="font-size:12.0pt;"> برای</span> <span style="font-size:12.0pt;">غلبه</span> <span style="font-size:12.0pt;">بر این</span> <span style="font-size:12.0pt;">موانع،</span> <span style="font-size:12.0pt;">فنآوری توالییابی نسل جدید (</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">NGS</span></span></span><span style="font-size:12.0pt;">)</span> <span style="font-size:12.0pt;">در شروع قرن 21 ارائه شد. این فنآوری، توالییابی بسیار کارآمد، سریع و کم هزینه را نسبت به فنآوری استاندارد و سنتی توسعه یافته در اواخر دهه 1970، فراهم نمود. در سال 2009 فنآوری </span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">NGS</span></span></span><span style="font-size:12.0pt;"> برای چندین جنبه ویروسشناسی گیاهی از جمله توالییابی ژنوم، کشف و ردیابی، اکولوژی، اپیدمولوژی و تکثیر ویروسها و ویروئیدها استفاده شد. انتظار میرود که فنآوری </span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">NGS</span></span></span><span style="font-size:12.0pt;"> نقش بسیار مهمی در بسیاری از تحقیقات ویروسشناسی گیاهی داشته باشد.</span></h2>
<p style="margin: 0px 0px 2.66px; text-align: justify; line-height: 150%;">Davoodi Z, Heidarnejad J and Masoumi H (2019) Next generation sequencing technique and its application in plant virology. Plant Pathology Science 8(2):77-85. DOI:10.2982/PPS.8.2.77<br>
<br>
DNA sequencing is used by virtually all branches of biological research. Among the first advanced sequencing technologies, scientists were able to elucidate genetic information from any particular biological system using the Sanger sequencing method. Although Sanger sequencing generates high quality sequencing data, its limitations such as scalability, speed and resolution often preclude scientists from obtaining the essential information. To overcome these barriers, next generation sequencing technique (NGS) was introduced at the beginning of the 21<sup>st</sup> century. This technique provided a highly efficient, rapid, and low cost DNA sequencing platform beyond the reach of the standard and traditional DNA sequencing technologies that developed in late 1970s. In 2009, NGS technologies began to be applied to several areas of plant virology including virus/viroid genome sequencing, discovery and detection, ecology, epidemiology and replication. It is expected that NGS plays very significant roles in many plant virology researches.<br>
</p>
توالییابی دیاِناِ, ویروئید, ویروس, Illumina/Solexa
DNA sequencing, Viroid, Virus, Illumina/Solexa
77
85
http://yujs.yu.ac.ir/pps/browse.php?a_code=A-10-265-1&slc_lang=fa&sid=1
zohreh
Davoodi
زهره
داودی
z.davoodi20@yahoo.com
10031947532846002808
10031947532846002808
Yes
Department of Plant Pathology, College of Agriculture, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran.
بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان
jahangir
heydarnejad
جهانگیر
حیدرنژاد
jhehdarnejad@uk.ac.ir
10031947532846002809
10031947532846002809
No
Department of Plant Pathology, College of Agriculture, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran.
بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان
Hossein
Masoomi
حسین
معصومی
masooi@uk.ac.ir
10031947532846002810
10031947532846002810
No
Department of Plant Pathology, College of Agriculture, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran.
بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان