پاکباز س، درویش‌نیا م، نقوی ا (1400)جایگاه نسب شناسی جدایه استان لرستان ایران ویروس برگ بادبزنی انگور. دانش بیماریشناسی گیاهی 11(1):12-1.
10.2982/PPS.11.1.1Doi:
مقدمه: ویروسبرگبادبزنی(GFLV) یک ویروس مهم آلوده کننده انگور در جهان است. مواد و روشها:انگورهای دارای نشانه GFLV از حومه شهر خرم‌آباد در استان لرستان ایران، در بهار 1399 نمونه‌برداری شدند و آزمون RT-PCR جهت تکثیر ژن GFLV-CP آنها انجام و محصول واکنش توالی‌یابی شد. یافته‌ها: آغازگرهای اختصاصی توانستند قطعه‌ای به طول bp 1515 مربوط به ژن CP را تکثیر کنند. بر اساس توالی نوکلئوتیدی این قطعه، GFLV برای نخستین بار در این منطقه شناسایی شد. تشابه ترادف نوکلئوتیدی این جدایه به میزان 64/95 -14/89 درصد با دیگر جدایه‌های موجود در بانک ژن NCBI تشخیص داده شد. همچنین در درخت نسب شناسی این جدایه ها بر اساس ناحیه ژنومی CP، جدایه‌های GFLV در دو گروه I و II خوشه‌بندی شدند. جدایه لرستان GFLV همراه با جدایه‌های GFLV متعلق به ناحیه شمال غربی کشور و جدایه شهر تاکستان در یک زیرشاخه در گروه I قرار گرفتند و جدایه‌های مربوط به سایر کشورها نیز در این گروه در یک زیرشاخه مجزا قرار گرفتند. همچنین جدایه‌های شرق کشور و استان‌های فارس و کهگیلویه و بویراحمد نیز در گروه II و در زیرشاخه‌های متفاوت قرار گرفتند. نتیجه‌گیری: یافته های این پژوهش بیانگر بومی بودن ویروس، خاستگاه احتمالی آن از ایران و سپس گسترش آن به سایر نقاط دنیا و نیز اثر جدایی جغرافیایی در تکامل GFLV می‌باشد.
جهاندیده م، نعمت اللهی س، رخشنده رو ف (1402) واکنش چهاررقم کدو به ویروس موزاییک خیار با آنالیز بیان ژنهای PAL و . PR2 دانش بیماریشناسی گیاهی 12(2): 26-11.
مقدمه: ویروس موزائیک خیار Cucumber mosaic virus, CMV)) یکی از مهمترین ویروسهای بیمارگر کدو است. شناسایی و کشت رقمهای مقاوم یا متحمل بهترین روش مدیریت بیماری است. پژوهش حاضر به منظور بررسی واکنش چهار رقم کدو نسبت به CMV با ارزیابی بیان ژنهای دخیل در مقاومت (PAL, PR2) انجام پذیرفت. مواد و روشها:چهل نمونه برگ کدوی مشکوک به بیماری از مزرعه های شمال غربی ایران جمع آوری و توسط آزمون TAS-ELISA بررسی شدند. یک جدایه CMV پس از خالصسازی بیولوژیکی برای بررسی واکنش چهار رقم کدوی تحت کشت در این منطقه به اسامی : اسما،پارس، پروف و PS در آزمایشی گلخانه ای به گیاهان مایه زنی شد. با آزمونهای TAS-ELISA و semi quantitative(Sq)-RT-PCR غلظت ویروس در رقمهای کدو بررسی و شاخص شدت بیماری تا ۳۰ روز پس از مایه زنی ارزیابی شد. میزان بیان ژن های PAL و PR2 نیز با تکنیک Real time PCRQuantitative بررسی شد.یافته ها: شانزده نمونه از مجموع 40 نمونه آلوده به CMV بودند. بررسی تیتر ویروس نشان داد که غلظت ویروس و شاخص شدت بیماری در دو رقم پارس و پروف نسبت به رقمهای PS واسما بالاتر بود. بیان ژنهای PAL و PR2 در همه رقمها نسبت به شاهد افزایش داشت ولی در رقم PS و پس از آن اسما بیشتر بود.نتیجه گیری: رقمهای PS و اسما از تحمل بالاتری نسبت بهCMV برخوردار هستند و کشت وسیعتر آنها برای مدیریت مفید است.
موزاییک زرد ناشی از ویروس موزاییک زرد جو (BaYMV)، که توسط شبه قارچ Polymyxa graminis منتقل میشود، یکی از بیماریهای مهم ویروسی جو در جهان است. برای ردیابی سرولوژیکی و مولکولی این ویروس از مزرعه های جو استان خراسان رضوی، شمال شرق ایران، 86 نمونه برگ به صورت تصادفی و یا دارای علایمی شامل موزاییک، زردی و رگبرگ روشنی در اوخر زمستان سال 1400، جمع آوری شدند. نمونه ها پس از انتقال به آزمایشگاه توسط آزمون های سرولوژیکی الایزا و مولکولی واکنش زنجیره‌ای پلیمراز- ترانسکریپتاز معکوس(RT-PCR) مورد بررسی قرار گرفتند. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی BaYMV طراحی شده، قطعه‌ای به طول 800 جفت باز مربوط به پروتیین پوششی ویروس تکثیر شد. از بین جدایه های مثبت آزمون RT-PCR، قطعه دی ان ا تکثیر شده مربوط به جدایه بجستان پس از استخراج از ژل، تعیین توالی گردید. توالی دریافتی جدایه بجستان , BaYMV پس از تایید صحت با استفاذه از برنامه بلاست، به همراه سایر توالی های پروتیین پوششی BaYMV موجود در بانک ژن NCBIبه وسیله نرم افزارهای DNAMAN-7 و Vector NTI مورد واکاوی فیلوژنتیکی قرار گرفت. قطعه تعیین توالی شده جدایه بجستان دارای بیشترین شباهت در سطح نوکلئوتیدی (79/94 درصد) و آمینواسیدی (59/90 درصد) با قطعه مشابه یک جدایه از اروپا بود. این اولین گزارش وقوع BaYMV از شهرستان بجستان استان خراسان رضوی ایران است.
