داودی ز، حیدرنژاد ج و معصومی ح (1398) تکنیکِ نسل جدید توالی‌یابی و کاربرد آن در ویروس‌شناسی گیاهی. دانش بیماریشناسی گیاهی 8(2):85-77. DOI: 10.2982/PPS.8.2.77
تعیین توالی دی‌اِن‌اِ درهمه شاخههایعلومزیستیکاربرد دارد. در میان اولین فن‌آوری‌های پیشرفته نسل توالی‌یابی، دانشمندانباظهورتوالییابیسنگر،توانستنداطلاعاتژنتیکیگونهها را در هر سیستمبیولوژیکی مشخصکنند. اگرچه هنوز هم این تکنیک به‌دلیل کیفیت توالی‌های خوانده شده، مورد توجه است، امامحدودیت هاییچونمقیاس کار،سرعتوتفکیکپذیریموانعیاستکهمانعدسترسی دانشمندانبهاطلاعات اساسیموردنیازشدهاست. برایغلبهبر اینموانع،فنآوری توالی‌یابی نسل جدید (NGS)در شروع قرن 21 ارائه شد. این فنآوری، توالی‌یابی بسیار کارآمد، سریع و کم هزینه را نسبت به فنآوری استاندارد و سنتی توسعه یافته در اواخر دهه 1970، فراهم نمود. در سال 2009 فنآوری NGS برای چندین جنبه ویروس‌شناسی گیاهی از جمله توالی‌یابی ژنوم، کشف و ردیابی، اکولوژی، اپیدمولوژی و تکثیر ویروس‌ها و ویروئیدها استفاده شد. انتظار می‌رود که فنآوری NGS نقش بسیار مهمی در بسیاری از تحقیقات ویروس‌شناسی گیاهی داشته باشد.
مقدمه: ویروس موزاییک خیار ((Cucumber mosaic virus, CMV یکی از شایع‌ترین بیمارگرهای گیاهان جالیز در دنیا محسوب می‌شود. بهترین روش مدیریت بیماری شناسایی و کشت رقمهای مقاوم است. مواد و روشها: واکنش 40 ژنوتیپ یا رقم از گیاهان تیره کدوییان شامل طالبی، خیار، خربزه، کدو و هندوانه نسبت به یک جدایه از CMV از زیرگروه IB در شرایط گلخانه در قالب طرح کاملاً تصادفی با 10 تکرار برای هر تیمار ارزیابی گردید. بوته‌ها در مرحله برگ‌های کوتیلدونی با عصاره توتون آلوده به CMV مایه‌زنی شدند. دو تا چهار هفته بعد از مایه‌زنی، واکنش آن‌ها بر اساس شاخص شدت نشانهو میزان جذب در آزمون الایزا (OD405) تعیین شد. یافته ها:ژنوتیپ‌ها در پنچ گروه کاملاً حساس، حساس، نسبتاً مقاوم، مقاوم و کاملاً مقاوم دستهبندی شدند. نتیجه گیری: کشت ژنوتیپ‌های کاملا مقاوم یا مقاوم را برای مدیریت بیماری میتوان توصیه کرد.
