<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Seed Research</title>
<title_fa>پژوهشهای بذر ایران</title_fa>
<short_title>Iranian J. Seed Res.</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://yujs.yu.ac.ir/jisr</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2383-1251</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2383-1480</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61882/yujs</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1404</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2025</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>12</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>کاربرد تحلیل واریانس تابعی در ارزیابی جوانه‌زنی در تحقیقات بذر</title_fa>
	<title>The Application of Functional Analysis of Variance in Assessing Germination in Seed Research</title>
	<subject_fa>سایر موضوعات</subject_fa>
	<subject>General</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align:justify&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,&amp;quot;serif&amp;quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:11.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;B Mitra&amp;quot;&quot;&gt;هدف: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:11.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;B Mitra&amp;quot;&quot;&gt;در این مطالعه تحلیل واریانس تابعی برای مقایسه جوانه&#8204;زنی تیمارها در یک بازه زمانی ارائه می&#8204;گردد. در این روش، نه تنها امکان مقایسه تیمارها در کل دوره زمانی قابل انجام می&#8204;باشد، بلکه مقایسه تیمارها در هر لحظه از زمان امکان&#8204;پذیر است. همچنین می&#8204;توان زمان&#8204;های مهم که در آنها تیمارها به حداکثر اختلاف معنی&#8204;دار می&#8204;رسند، مشخص کرد که می&#8204;تواند به عنوان شاخص&#8204;های جوانه&#8204;زنی مورد استفاده قرار گیرد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:12pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,&amp;quot;serif&amp;quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:11.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;B Mitra&amp;quot;&quot;&gt;روش پژوهش: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:11.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;B Mitra&amp;quot;&quot;&gt;در این پژوهش، از داده&#8204;های واقعی مربوط به چهار آزمایش شامل اثر دما بر جوانه&#8204;زنی سیاه&#8204;دانه، اثر تنش شوری بر جوانه&#8204;زنی بذرهای ذرت، مقایسه جوانه&#8204;زنی ارقام مختلف گندم و اثر تنش آبی بر جوانه&#8204;زنی گیاه کلزا استفاده گردید و با استفاده از تابع اسپیلاین داده&#8204;های حاصل از جوانه&#8204;زنی در این آزمایش&#8204;های به عنوان تابعی از زمان بیان شد. سپس، نتایج تحلیل تابعی برای مقایسه&#8204;های تیمارها هم از لحاظ میزان جوانه&#8204;زنی و هم از لحاظ زمان جوانه&#8204;زنی در این چهار آزمایش به تفصیل ارائه گردید.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:12pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,&amp;quot;serif&amp;quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:11.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;B Mitra&amp;quot;&quot;&gt;یافته&#8204;ها: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:11.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;B Mitra&amp;quot;&quot;&gt;نتایج استفاده از تحلیل تابعی بیانگر کارایی بالای این روش در مشخص&#8204;سازی اختلاف یا عدم اختلاف معنی&#8204;دار بین تیمارها در طول دوره زمانی بود. همچنین، مقایسه تیمارها از لحاظ جوانه&#8204;زنی در هر لحظه از زمان و مقایسه زمان جوانه&#8204;زنی در هر صدک جوانه&#8204;زنی اطلاعات دقیقی از نحوه اختلاف بین تیمارها فراهم کرد. این رویکرد امکان معرفی شاخص&#8204;های جدید جوانه&#8204;زنی در بذرهای مختلف را فراهم کرد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:12pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,&amp;quot;serif&amp;quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:11.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;B Mitra&amp;quot;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:11.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;B Mitra&amp;quot;&quot;&gt;به طور کلی نتایج این تحقیق نشان داد که برای مقایسه تیمارها برای داده&#8204;های جوانه&#8204;زنی، تحلیل تابعی گام به گام که در این پژوهش معرفی گردید یک روش کارامد و دقیق برای مقایسه تیمارها و استخراج جزئیات از نحوه اختلاف بین تیمارها می&#8204;باشد. همچنین این روش محدودیت&#8204;های استفاده از شاخص&#8204;های جوانه&#8204;زنی برای مقایسه تیمارها را مرتفع می&#8204;کند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:12pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,&amp;quot;serif&amp;quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:11.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;B Mitra&amp;quot;&quot;&gt;جنبه&#8204;های نوآوری:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;b&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size:11.0pt&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;ul&gt;
	&lt;li dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;margin-right:24px; text-align:justify&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:115%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Calibri,&amp;quot;sans-serif&amp;quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:115%&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-family:&amp;quot;B Mitra&amp;quot;&quot;&gt;از تحلیل تابعی برای مقایسه تیمارها در داده&#8204;های درصد جوانه&#8204;زنی استفاده شد.&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-family:&amp;quot;B Mitra&amp;quot;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/li&gt;
	&lt;li dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;margin-right:24px; text-align:justify&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:115%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Calibri,&amp;quot;sans-serif&amp;quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:115%&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-family:&amp;quot;B Mitra&amp;quot;&quot;&gt;امکان مقایسه تیمارها از لحاظ درصد جوانه&#8204;زنی در هر لحظه از زمان و از لحاظ زمان&#8204;ها در هر صدک جوانه&#8204;زنی فراهم شد&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-family:&amp;quot;B Mitra&amp;quot;&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/li&gt;
	&lt;li dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;margin-right:24px; text-align:justify&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;B Mitra&amp;quot;&quot;&gt;زمان و صدک جوانه&#8204;زنی مهم که در آن بیشترین اختلاف بین تیمارها وجود دارد به عنوان شاخص&#8204;های جدید جوانه&#8204;زنی معرفی گردید.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align:justify&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:14.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,&amp;quot;serif&amp;quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;Objective&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;: This study introduces functional analysis of variance as a method for comparing germination trends under different treatments over a given time interval. This approach not only enables the comparison of treatments over the entire time period but also allows for treatment comparisons at each specific moment in time. Moreover, it identifies critical time points at which the maximum significant difference between treatments occurs, which can serve as novel germination indices.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:12pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:14.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,&amp;quot;serif&amp;quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;Method&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;: In this study, real experimental data from four germination studies were analyzed: (1) the effect of temperature on &lt;i&gt;Nigella sativa&lt;/i&gt; germination, (2) the effect of salinity stress on &lt;i&gt;Zea mays&lt;/i&gt; seed germination, (3) the comparison of germination among different &lt;i&gt;Triticum astivum&lt;/i&gt; cultivars, and (4) the effect of water stress on &lt;i&gt;Brassica napus&lt;/i&gt; germination. Using spline functions, germination data from these experiments were modeled as a function of time. The results of functional analysis were then used to compare treatments in terms of both germination percentage and germination time across the four experiments.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:12pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:14.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,&amp;quot;serif&amp;quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;Results&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;: The results of the functional analysis demonstrated its high efficiency in detecting significant or non-significant differences between treatments throughout the germination period. Furthermore, this method enabled comparisons of germination percentages at any given time point, as well as comparisons of germination times at various germination percentiles, providing detailed insights into the nature of differences among treatments. This approach also facilitated the introduction of new germination indices applicable to different seed types.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,&amp;quot;serif&amp;quot;&quot;&gt;Conclusions&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,&amp;quot;serif&amp;quot;&quot;&gt;: Overall, the results of this study indicate that the stepwise functional analysis method introduced here is an effective and precise tool for comparing treatments in germination data. This approach not only enhances treatment comparisons but also provides detailed insights into the nature of differences between treatments. Moreover, it overcomes the limitations associated with using conventional germination indices for treatment comparisons.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:12pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,&amp;quot;serif&amp;quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span style=&quot;color:#000099&quot;&gt;Highlights&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;ul&gt;
	&lt;li style=&quot;margin-bottom:13px; margin-left:8px; text-align:justify&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:115%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Calibri,&amp;quot;sans-serif&amp;quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:115%&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:115%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,&amp;quot;serif&amp;quot;&quot;&gt;Functional analysis was applied to compare treatments in germination percentage data.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/li&gt;
	&lt;li style=&quot;margin-bottom:13px; margin-left:8px; text-align:justify&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:115%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Calibri,&amp;quot;sans-serif&amp;quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:115%&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:115%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,&amp;quot;serif&amp;quot;&quot;&gt;The method enabled treatment comparisons in terms of germination percentage at each moment in time, as well as comparisons of germination times at various percentiles.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/li&gt;
	&lt;li style=&quot;margin-bottom:13px; margin-left:8px; text-align:justify&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:115%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Calibri,&amp;quot;sans-serif&amp;quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:115%&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:115%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,&amp;quot;serif&amp;quot;&quot;&gt;Critical germination times and percentiles at which the maximum differences between treatments occur were introduced as novel germination indices.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;</abstract>
	<keyword_fa>تحلیل تابعی, تابع اسپیلاین, روش جایگشتی,  شاخص جوانه‌زنی, مونت‌کارلو</keyword_fa>
	<keyword>Functional analysis, Germination index, Monte Carlo, Permutation method, Spline function</keyword>
	<start_page>77</start_page>
	<end_page>96</end_page>
	<web_url>http://yujs.yu.ac.ir/jisr/browse.php?a_code=A-10-565-3&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Farshid</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ghaderi-Far</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>فرشید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>قادری فر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>farshidghaderifar@gau.ac.ir</email>
	<code>100319475328460013001</code>
	<orcid>100319475328460013001</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Agronomy, Gorgan University of Agricultural Science and Natural Resources, Gorgan, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Majid</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Azimmohseni</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مجید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عظیم محسنی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>m.azimmohseni@gu.ac.ir</email>
	<code>100319475328460013002</code>
	<orcid>100319475328460013002</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Statistics, Golestan University, Gorgan, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه گلستان</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Sima</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Sheikhveisi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سیما</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شیخ ویسی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>sima.shv.1992@gmail.com</email>
	<code>100319475328460013003</code>
	<orcid>0009-0002-5952-8486</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Graduated of Statistics, Department of Statistics, Golestan University, Gorgan, Iran. </affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه گلستان</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
